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É o órgão através do qual a Diretoria desempenha sua ação executiva, atuando diretamente sobre os órgãos técnicos e auxiliares integrantes da estrutura da Entidade.
Compete a ela coordenar as atividades dos órgãos técnicos e auxiliares do CFO e assessorar a Diretoria, o Plenário e a Assembleia Conjunta (CFO e presidentes de CROs), além de planejar os programas de orientação técnica dos CROs.

Superintendente executivo: Antônio Márcio Coimbra.
E-mail: superintendencia@cfo.org.br